ПУСТИНЬ — МОРФЕМІКА

пу́стинь — /пу́ст/инь

пуст — корінь.
инь — суфікс.

пусти́ня — /пуст/и́н*я

пуст — корінь.
ин — суфікс.
я — закінчення (флексія).
Словник афіксальних морфем української мови / Н. Ф. Клименко, Є. А. Карпіловська, В. С. Карпіловський, Т. І. Недозим; Ін-т мовознавства ім. О. О. Потебні НАН України. – Київ: [б.в.], 1998. – 440 с.